细菌可以应对不同环境胁迫如营养贫瘠和重金属污染等。该文重点分析了大肠杆菌细胞在应对营养贫瘠、重金属污染、温度变化以及抗生素等逆境时,其基因组和转录组变化特点和与其环境适应之间的相互关系。发现基因组突变主要集中于与转录有关的RNA聚合酶(RNAP)和转录因子等基因;突变类型包括单核苷酸多态性(SNPs)、删除或插入突变、染色体重拍以及基因拷贝数变化等。基因组突变导致转录组的变化,而转录组变化特点与选择环境胁迫类型有关,而转录组变化特点决定细菌对其特异性环境的适应性。
内蒙古大学生命科学学院/内蒙古细胞分子调控重点实验室焦建璐、吕晓丽(现就职于内蒙古医科大学药学院)、沈崇杰和莫日根撰写的“Genome and transcriptomic analysis of the adaptation of Eshcherichia coli to environmental stresses”一文,近日发表于Computational and Structural Biotechnology Journal(CSBJ),该期刊是中国科学院二区,JCR Q1,影响因子6,由ELSEVIER出版的国际期刊。该文第一作者为博士研究生焦建璐,吕晓丽博士和硕士研究生沈崇杰为共第一作者,莫日根教授为通讯作者。
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全文见如下链接:
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2024.05.033